গণপ্রজাতন্ত্রী বাংলাদেশ সরকারের Rules of Business, 1996-এর Schedule I এবং Allocation of Business Among the Different Ministries and Divisions (Revised up to April 2017) অনুসারে প্রতিরক্ষা মন্ত্রণালয়ের কার্যাবলি নিম্নরূপ:

১. বাংলাদেশের প্রতিরক্ষা।      

২. জাতীয় জরুরি অবস্থা/যুদ্ধ ঘোষণাকালীন প্রতিরক্ষা কর্মবিভাগসমূহের পরিকল্পনা, সমন্বয় ও সমবেত করার ব্যবস্থা করা ব্যতীত বাংলাদেশের প্রতিরক্ষা কর্মবিভাগসমূহ ও বাংলাদেশের যে কোন সশস্ত্র বাহিনীর সঙ্গে সংযুক্ত বা পরিচালিত সশস্ত্র বাহিনীসমূহ এবং অসামরিক প্রশাসনের সাহায্যার্থে নিয়োজিত থাকাকালে প্রতিরক্ষা কর্মবিভাগসমূহের কার্যাবলি সমন্বয় ও নিয়ন্ত্রণ করা।     

৩. সেনা, নৌ ও বিমানবাহিনীর কর্মসমূহ।       

৪. সাইফার দলিলপত্র প্রস্ত্ততকরণ।     

৫. যুদ্ধরতদের জন্য আন্তর্জাতিক রেডক্রস এবং জেনেভা কনভেনশনসমূহ যতদূর সম্ভব কার্যকর।     

৬. মন্ত্রণালয়ের আওতাধীন বাহিনীসমূহের বীরত্বপূর্ণ কাজের জন্য পুরস্কার ও ভূষণ প্রদান।     

৭. সামরিক ভূমি ও ক্যান্টনমেন্ট।     

৮. আবহাওয়া পর্যবেক্ষণ।     

৯. সশস্ত্র বাহিনীর সকল সদস্যের দণ্ড মার্জনা, বিলম্বন ও বিরাম ইত্যাদি।    

১০. জাতীয় কর্মবিভাগসমূহ এবং বাংলাদেশ জাতীয় ক্যাডেট কোর অধিদপ্তর (বিএনসিসি)।

১১. ক্যাডেট কলেজ সংক্রান্ত বিষয়সমূহ।     

১২. মহাকাশ গবেষণা ও দূর-অনুধাবন সংস্থা (স্পারসো) সংক্রান্ত বিষয়সমূহ।     

১৩. প্রতিরক্ষা হিসাব থেকে ব্যয় নির্বাহকৃত অসামরিক কর্মবিভাগসমূহ।     

১৪. জলভাগ সম্পর্কিত জরিপ এবং নৌপথ সংক্রান্ত মানচিত্র প্রণয়ন (বাংলাদেশের অভ্যন্তরীণ জলভাগের জরিপ ও অভ্যন্তরীণ নৌপথের মানচিত্র প্রণয়ন ব্যতীত)।   

১৫. বাংলাদেশ জরিপ সংক্রান্ত বিষয়সমূহ।

১৬. সশস্ত্র বাহিনীর বাজেট, আইনগত ও সংবিধিবদ্ধ বিষয়সমূহ।     

১৭. আর্থিক বিষয়সহ সচিবালয় প্রশাসন।    

১৮. এ মন্ত্রণালয়ের অধঃস্তন দপ্তর এবং সংস্থাসমূহের প্রশাসন ও নিয়ন্ত্রণ।     

১৯. আন্তর্জাতিক সংস্থার সঙ্গে লিয়াজোঁ এবং এ মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত বিষয়সমূহ সম্পর্কে অন্যান্য দেশ ও বিশ্ব সংস্থার সঙ্গে চুক্তি ও সমঝোতা সম্পর্কিত বিষয়।       

২০. এ মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত বিষয়ে সকল আইন।

২১. এ মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত যে কোন বিষয়ে তদন্ত ও পরিসংখ্যান।

২২. আদালতে গৃহীত ফি ব্যতীত এ মন্ত্রণালয়ে বরাদ্দকৃত যে কোন বিষয় সম্পর্কিত ফি।